يتولى نائب مدير المركز معاونة مدير المركز في إدارة الأعمال التنفيذية اليومية، ويُعنى بصفة خاصة بمتابعة الشؤون المالية والإدارية للمركز، بما يضمن الانضباط المالي وحسن سير العمل الإداري.
ويقوم مقام مدير المركز عند غيابه، ويتولى تنسيق العمل بين القطاع الإداري والمالي وبقية القطاعات التنفيذية، ويشارك في إعداد الموازنة والتقارير المالية ومتابعة تنفيذها.
يرتبط نائب مدير المركز بمدير المركز مباشرة، ويتولى الإشراف الوثيق على القطاع الإداري والمالي بالتنسيق مع بقية القطاعات.
